Was in Jena auf dem Gebiet der Ökumene in den letzten Jahren gewachsen ist, stimmt zuversichtlich. Große katholische Gottesdienste, z.B. die Christmette, die Feiern der Erstkommunion und der Firmung finden seit vielen Jahren in der Stadtkirche statt. Die ARD übertrug zu Weihnachten 2004 die katholische Christmette live aus der evangelischen Stadtkirche St. Michael. Superindentend Kamm eröffnete als evangelischer Gastgeber den Gottesdienst.

1996 wurde die „Arbeitsgemeinschaft Christlicher Kirchen in Jena“ (ACK) ins Leben gerufen, in der neben den evangelisch-lutherischen Kirchgemeinden, der katholischen Pfarrgemeinde auch die Landeskirchliche Gemeinschaft, die evangelisch-freikirchliche Gemeinde (Baptisten), die evangelisch methodistische Kirche, die Gemeinschaft der Siebenten-Tags-Adventisten und die Pfingstgemeinde vertreten sind.

Höhepunkt der Arbeit sind neben ökumenischen Gottesdiensten die regelmäßigen Ökumenischen Kirchentage.